药物基因组学和药物蛋白质组学杂志

抽象的

生物信息学方法分析结肠炎的口腔和肠道微生物组

萨默德·N·曼达佩

生物信息学和高通量测序技术的进步大大提高了我们探索人类微生物组的能力。对 16S 核糖体 RNA (rRNA) 进行测序以了解人类微生物组的分类组成。在本研究中，使用微生物生态学定量洞察 (QIIME) 对患病（克罗恩氏结肠炎 (CC) 或溃疡性结肠炎 (UC)）和邻近健康结肠样本的 16S rRNA 测序数据进行生物信息学分析。此外，考虑到这些样本的种族特定信息，对非裔美国人和高加索人之间的结肠微生物组差异进行了比较。结果，鉴定了 208 种不同的细菌种类。然而，在物种水平上描述了只有 53 种细菌。患病 CC 和 UC 样本中无害细菌的比例与邻近健康结肠样本不同。此外，患病样本的微生物组以厚壁菌门（链球菌、葡萄球菌、消化链球菌）和梭杆菌门（梭杆菌）的口腔细菌为主。结果还显示非裔美国人和白种人的微生物组存在差异，表明研究重点可能集中在健康差异上。