迪内什·辛格、什维塔·辛哈、加里马·乔杜里和亚达夫·DK
引起番茄(Solanum lycopersicum L.)青枯病的青枯菌生物变种 3 和 4 是一种在世界范围内具有毁灭性的土传植物病原体。从印度查谟和克什米尔邦、喜马偕尔邦、北阿坎德邦、恰尔肯德邦、奥里萨邦的枯萎番茄植株中分离出 87 个青枯菌分离株,并用传统方法和分子生物学方法对其进行了鉴定。使用一组碳源确定青枯菌生物变种,结果表明,青枯菌生物变种 3 在印度所有邦最为突出(90.2%),而生物变种 4 则见于恰尔肯德邦和喜马偕尔邦。种系型特异性多重 PCR 将感染番茄的所有 87 个青枯菌分离株归入种系型 I。为了研究遗传多样性,使用了 BOX-PCR 和多位点序列分型方法。扩增产物以 BOX-PCR 指纹图谱显示,范围为 500 bp -4 kb,在 50% 相似系数下,发现 87 个 R. solanacearum 分离株有 23 个 DNA 分型组。在多位点序列分型下,对属于不同农业气候区的 18 个 R. solanacearum 菌株进行了三种毒力基因即 hrp(调节性转录调控)和 egl(内切葡聚糖酶前体)和 fli C 基因的检测。基于 egl 基因序列分析,除 ORT-8、UTT-23 和 JHT2 外,大多数印度 R. solanacearum 菌株彼此非常接近,并且与菌株 GMI1000 非常接近。无论分离地点和气候条件如何,R. solanacearum 的印度分离株都存在很大的遗传变异。