干细胞研究与治疗杂志

抽象的

差异 miRNA 表达导致人类结直肠癌中多种癌症干细胞亚群的出现

Victoria A. Stark、Caroline OB Facey、Lynn M. Opdenaker、Jeremy Z. Fields、Bruce M. Boman1

癌症治疗缺乏疗效的一个原因是肿瘤异质性。我们假设肿瘤异质性是由于多种癌症干细胞 (CSC) 亚群的出现而产生的，因为 miRNA 调节 CSC 中干细胞基因的表达。我们的目标是确定：i) 人类 CRC 细胞群中是否存在多种 CSC 亚群，以及 ii) miRNA 在不同的 CSC 亚群中是否存在差异表达。我们发现 HT29 细胞系中至少存在四种不同的 CSC 群体 (ALDH1、CD166、LGR5 和 LRIG1)。使用多种干细胞标记物的共染色对 CSC 亚群进行量化，使用 FACS 进行分离，并通过 NanoString miRNA 分析进行分析。分析了每个 CSC 亚群中的 miRNA 表达模式相对于其他 CSC 亚群中的 miRNA 表达模式。预测每个 CSC 亚群中上调 miRNA 靶向的信使 RNA：1) 使用生物信息学分析进行识别，2) 使用 David 功能注释分析根据其预测功能进行分类。我们发现每个 CSC 亚群中都有多个具有独特 miRNA 特征的 CSC 亚群。值得注意的是，预测在一个 CSC 亚群中表达的 miRNA 会靶向和下调建立其他 CSC 亚群的 CSC 基因和通路。此外，预测不同 CSC 亚群中 miRNA 靶向的 mRNA 具有不同的细胞功能分类。不同的 CSC 亚群表达的 miRNA 被预测为靶向其他 CSC 亚群中表达的 CSC 基因，这提供了一种机制，可以解释多个 CSC 亚群、肿瘤异质性和癌症治疗耐药性的共存。