基因科技

抽象的

液滴数字 PCR 为识别生物标志物 FcγRIIIa-F158V 基因型提供了一种快速、准确且经济有效的方法

Paul Griffith、David Sun、Sarah R Tritsch、Caroline Jochems、James L Gulley、Jeffrey Schlom 和 Xiaolin Wu

新型单克隆抗体、疫苗和溶瘤病毒疗法的开发依赖于对生物标志物的分析，将其作为成功的潜在预测因素。一种研究透彻的生物标志物是 CD16/FcγRIIIa 受体残基 158 F/V。通过对 FcγRIIIa 基因座进行基因分型来识别变异体被广泛使用，并且多种多样，常用方法包括：Sanger 测序、流式细胞术、PCR/RFLP、Goldengate（由 Infinium 取代）和 TaqMAN 分析。虽然这些方法在与 CD16 FcγRIIIa 158 F/V 相关的出版物中都得到了大量支持，但大多数方法在以省时省钱的方式识别纯合子（野生型和突变型）和杂合子方面存在重大缺陷。利用液滴数字 PCR 和 FcγRIIIa-F158V 特异性探针，可以直接识别基因组样本中的序列，从而以更低的平均成本和更快的周转时间进行准确的基因分型。这里我们展示了如何使用 ddPCR 准确识别 FcγRIIIa-F158V 基因型，并通过 Illumina 测序对 128 个患者样本进行确认。