抽象的

非裔美国人的年龄表观基因组指标

Jennifer A Smith、Alicia L Zagel、Yan V Sun、Dana C Dolinoy、Lawrence F Bielak、Patricia A Peyser、Stephen T Turner、Thomas H Mosley Jr 和 Sharon LR Kardia

年龄是慢性疾病的已知风险因素。然而,与慢性疾病的发生和发展相关的衰老过程相关的细胞和分子变化尚不明确。因此,越来越需要确定衰老过程中发生的细胞和分子变化的新标记。在本研究中,我们使用来自 13,877 个基因中的 26,428 个 CpG 位点的全基因组 DNA 甲基化来研究来自动脉病遗传流行病学网络 (GENOA) 研究的 972 名非裔美国成年人外周血细胞中年龄与表观遗传变异之间的关系(平均年龄 = 66.3 岁,范围 = 39-95)。在 Bonferroni 校正 α=0.05 后,年龄与 7,601 (28.8%) 个 CpG 位点显着相关(p<1.89×10-6)。由于年龄与许多 CpG 位点之间存在极强的关联性(超过 7,000 个位点,p值范围从 10-6 到 10-43),我们研究了 DNA 甲基化标记预测年龄的效果。我们发现,经过 Bonferroni 校正后,2,095 个(7.9%)CpG 位点是年龄的显著预测因子。2,095 个与年龄相关的 CpG 位点的前五个主成分解释了这些 CpG 位点 69.3% 的变异性,并解释了 26.8% 的年龄变异。甲基化标记与成人年龄之间的关联如此普遍和强烈,以至于我们假设 DNA 甲基化模式可能是细胞衰老过程的重要指标。鉴于与年龄相关的表观基因组具有高度相关性(如主成分分析所证明的),整个途径可能因衰老而受到调节。

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