王耀峰、张俊、郭俊涛、冯波
哺乳动物中发现的多能性胚胎干细胞 (ESC) 极大地改变了干细胞研究和再生医学。为了了解多能性的分子机制,大规模测序技术因其优势而引起了科学界的浓厚兴趣,包括高分辨率、低噪音以及对整个基因组的广泛覆盖。本文将回顾在 ESC 研究中广泛使用的全基因组大规模测序技术的原理,包括 ChIP-Seq、RNA-Seq 和 methylCSeq。还将讨论这些技术的最新改进和应用。此外,还将介绍用于整合大规模全基因组测序数据的各种方法的摘要。整合描述 ESC 不同方面的海量数据可以促进许多创新,以了解维持多能性的转录网络以及 ESC 中的基因调控和表观遗传修饰,这对研究和临床应用都很重要。此外,我们强调了由于当前生物信息学和生物统计学中海量测序数据分析面临的挑战而值得生物学家关注的特点。