生物化学与分析生物化学

抽象的

Human.miRFFL.DB：人类 miRNA 共调节网络和相关调节回路的精选资源

Pankaj Khurana*、Rajeev Varshney、R Sugadev

基因调控被视为一个复杂的过程，其中调控元件及其靶标形成高度复杂的网络相互作用，从而影响正常的生物生理学以及疾病的发生和发展。转录因子 (TF) 和微小 RNA (miRNA) 是控制重要生物过程的基因表达的基本转录和转录后调节因子。近年来，许多高通量研究表明，复杂的调控相互作用是由 miRNA 和 TF 之间复杂的相互作用介导的，它们共同调节靶基因 (TG)。众所周知，miRNA 和 TF 也会相互调节。这种复杂的共调节机制可以表示为 miRNA:TF:TG 共调节网络的形式。该网络可用于识别几个称为调节电路的小循环子图。这些调节电路之一也称为前馈回路 (FFL)，是一种三节点模式，由 miRNA 和 TF 组成，其中一个调节另一个，两者共同调节 TG。这些调节回路已被证明有助于阐明许多生理和病理条件下基因调控的复杂相互作用。

Human.miRFFL.DB 是人类 miRNA:TF:TG 共调节定向网络及其相关调节电路的综合集成资源。基于图论原理的内部脚本已用于识别两种类型的 FFL 基序，即 miRNA-FFL 和 TF-FFL。该数据库还提供了共调节网络和相关 FFL 的交互式可视化。Human.miRFFL.DB 可用作人类 miRNA:TF:TG 共调节网络和相关 FFL 的综合现成参考，用于解密这些调节生物分子的复杂细胞相互作用。Human.miRFFL.DB 可在线访问，网址为 http://mirffldb.in/human/