微生物与生化技术杂志

抽象的

通过 DNA 条形码鉴定木霉菌属并筛选纤维素分解活性

Abdelmegid I Fahmi、Ragaa A Eissa、Khalil A El-Halfawi、Hanafy A Hamza 和 Mahmoud S Helwa

对来自埃及尼罗河三角洲不同地区的木霉菌分离物进行了物种鉴定，并分析了它们的纤维素分解活性。根据形态特征，75% 的分离物被鉴定到物种水平，并将它们分成四个聚合组。仅凭形态学表征不足以准确鉴定木霉菌种，因为它们的形态特征相对较少，变异有限，导致分离物重叠和错误鉴定。因此，有必要使用分子技术来弥补形态学表征的局限性。使用特异性引物 ITS1 和 ITS4 对 5.8S-ITS 区进行 DNA 测序。通过使用 BLAST 程序将 5.8S-ITS 区的序列与 GenBank 中存储的序列进行比较，所有分离物都可以鉴定到物种水平，同源性百分比至少为 99%。此外，使用 TrichOKEY 搜索工具评估了 Genbank 的可靠性，结果与 BLAST 结果一致率为 92%。数据表明物种多样性狭窄，主要有两个物种占主导地位，即 T. longibarchiatum 和 T. harzianum。分离株的核苷酸分布以及 ITS 区域的 (G+C) 含量表明物种间变异范围很广。最后，使用纤维素天青法评估分离株的总纤维素酶活性，使用 Avicel 法评估外切葡聚糖酶活性，使用羧甲基纤维素 (CMC) 和酸膨胀纤维素法评估内切葡聚糖酶活性。因此，在 28 个分离株中，选出 11 个分离株作为纤维素分解能力最好的分离株。