微生物与生化技术杂志

抽象的

大肠杆菌中 YdcI 转录调节因子对 TCA 循环的代谢控制

西尾阳介、铃木智子、松井和彦、臼田义宏

了解编码代谢酶的基因表达的调控对于利用微生物进行生产至关重要。为了克服识别调控网络系统所涉及的技术困难，我们设计了一种结合转录组和基因组序列数据的 DNA 基序查找程序。在这里，我们使用大肠杆菌的 ArcAB 双组分系统（该系统控制参与 TCA 循环和能量代谢的基因）作为模型来识别参与基因表达调控的 DNA 基序。DNA 阵列数据用于从 ΔarcA 和 ΔarcB 大肠杆菌菌株中提取上调基因，并对上游序列进行 DNA 基序查找。序列相似性和保守残基确定了已知的 ArcA 结合基序和一种新的 DNA 基序候选物，估计该候选物与假定的 LysR 型转录调节因子 YdcI 有关。在 gltA 基因上游发现了一个假设的 YdcI 结合基序，这表明 YdcI 可能控制进入 TCA 循环的碳通量。为了验证这一点，我们研究了 ydcI 基因扩增菌株中的 l-谷氨酸产量和柠檬酸合酶活性。我们的研究结果表明，YdcI 是一种转录因子，它调节 gltA 和其他基因的表达，并控制碳流入 TCA 循环。