基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

人类气孔素的分子建模与模拟及其膜结合的预测

近藤洋介、横山秀志、松井郁夫、宫崎悟

Stomatin 是人类红细胞中的一种膜蛋白。超嗜热古菌 Pyrococcus horikoshii 的单体 Stomatin 由 α/β 结构域和 C 端 α 螺旋片段组成，形成同源三聚体，而 Stomatin 则进一步组合成包含 9 到 12 个聚体的高级同源寡聚复合物。为了更好地理解 Stomatin 的分子功能，应验证人类 Stomatin 如何寡聚化并与细胞膜结合的假设。在这里，我们通过评估人类 Stomatin α 螺旋片段的灵活性来报告可以从 Stomatin 结构中产生哪些构象。并且我们还模拟了人类 Stomatin 的寡聚结构如何与细胞膜相互作用。结果表明，α 螺旋片段可以进行灵活的运动；单体的α螺旋片段与α/β结构域可以形成扁平结构，三聚体的α螺旋片段可以接近脂质膜。基于人stomatin的扁平结构，我们提出了一种假想的寡聚模型来与细胞膜表面相互作用。寡聚模型很好地解释了stomatin作为支架蛋白支持细胞膜的功能。