基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

参芪扶正注射液对人树突状细胞microRNA影响的研究

Yuwh H、Sze WH、Yip DMY、Cho SP、Boost WCS、Zhang MV、Fan Z、Ng K、Ng MCH、Yeung JWC、Hung A、H WH、Chong GSL 和 Lee RLP

方法：本研究采用两步法。首先，我们使用强大的 DC 细胞系来识别可能参与 DC 激活的 miRNA；然后使用更接近真实生理环境的单核细胞衍生 DC 进行确认。THP-1 细胞是一种人类单核细胞白血病细胞系，之前已被证明可用于 DC 的体外研究。在本研究中，我们使用 381 个已知人类 miRNA 的 MicroRNA 阵列（Sanger miR Base，版本 14）在 SFI 激活的 DC 中识别了许多潜在的 miRNA 候选物。然后根据注释数据库管道 miR Base 中检索到的计算证据，从 30 多个相对表达倍数变化 >2 的潜在 miRNA 候选物中选择了 miR-22、miR-107 和 miR-200a。通过实时 RT-PCR 定量分析健康正常受试者 (n=7) 外周血单核细胞中的单核细胞衍生树突状细胞 (MDDC)，在验证性研究中进一步检查了这三种 miRNA 的表达变化。使用流式细胞术将这些结果与 MDDC 上 HLA-DR 和 CD80 的表达水平相关联。结果：验证结果未显示七个 MDDC 样本中 SFI 导致 miR22、miR107 和 miR-200a 表达有任何一致的上调。此外，在 1/20 和 1/40 两种不同稀释度的 SFI 处理 MDDC 24 小时后的测试结果也显示 HLA-DR 和 CD80 的表达变化不显著 (p>0.05)。此外，在用 1/20 稀释的 SFI 处理 1 小时、用 1/20 稀释的 SFI 处理 4 小时和用 1/40 稀释的 SFI 处理 1 小时的 MDDC 中，三种 mi-RNA 的表达与 HLA-DR 和 CD80 的表面表达水平的相关性无统计学意义（p>0.05）。结论：仅在 THP-1 细胞系中发现 miR-22、miR-107 和 miR-200a 的 miRNA 表达增加，但在七个人外周血样本的 MDDC 中未能持续显示。因此，这三种 mi-RNA 是否是 SFI 作用于 DC 过程中真正重要的表观遗传调控因子仍不清楚；并且需要使用多个可靠的 DC 来源进行更多未来研究。