抽象的

16S-23S 基因间隔 (ITS) 区域序列分析:在识别与非溶血性链球菌相似的属和种中的适用性和实用性

陈晓慧、Derya Carkaci、Rimtas Dargis、Lise Hannecke、Ulrik Stenz Justesen、Michael Kemp、Jens Jørgen Christensen 和 Monja Hammer

过氧化氢酶阴性、革兰氏阳性球菌并且不属于链球菌或肠球菌的物种已越来越清楚地被表征,基于分子分类学研究的分类实体数量也在稳步增长。这使它们的鉴定变得复杂。16S-23S 基因间隔 (ITS) 区域序列分析已被证明是链球菌属和肠球菌属物种鉴定的有用工具。本研究调查了使用 ITS 序列分析作为 Aerococcus、Abiotrophia、Alloiococcus、Dolosicoccus、Dolosigranulum、Facklamia、Granulicatella、Gemella、Ignavigranum、Leuconostoc 和 Vagococcus 属物种鉴定的常用工具的可能性。确定了 29 种类型菌株和 103 种特征明确的临床菌株的 ITS 序列,并进行了 BLAST 分析以进行物种鉴定。所有临床菌株都被令人信服地鉴定到物种水平。系统发育分析显示,菌株与分配的物种和相应的类型菌株明显聚类。因此,ITS 序列分析可用于鉴定属于过氧化氢酶阴性和革兰氏阳性球菌属的细菌种类。ITS 可能被视为过氧化氢酶阴性、革兰氏阳性球菌组(包括非溶血性链球菌、肠球菌和本研究中检查的分类单元)的一线鉴定工具。

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