基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

转基因和非转基因大豆种子蛋白质和酚类化合物的比较

Savithir S Natarajan*、Farooq H Khan、Davanand L Luthria、Mark L Tucker、宋其健、Wesley M Garrett

大豆蛋白是人类和动物饮食中一种宝贵而重要的成分。美国种植的大豆中约有 94% 是转基因大豆，以提高质量和产量。由于增值特性不断通过基因改造得到开发，因此确定转基因大豆种子中是否发生任何意外变化非常重要。在本次研究中，我们选择了三种不同的转基因品系，分别记为事件 1、2 和 3，其中插入了一个农杆菌 T-DNA，其中包括抗除草剂选择基因 (bar) 和 β-葡糖醛酸酶 (GUS) 报告基因，分别使用双 35S 花椰菜花叶病毒 (CaMV) 启动子和大豆多聚半乳糖醛酸酶 (Glyma12g01480) 启动子表达。转基因品系和非转基因品系 祖细胞同工酶（对照）用于蛋白质组学和酚类化合物分析。种子蛋白 通过二维聚丙烯酰胺凝胶电泳 (2D-PAGE) 分离。在每个蛋白质提取物中检测到的大约 1300 个蛋白质点中，根据软件确定的对照和三个事件的蛋白质凝胶中相对丰度差异 (ANOVA)，选择了 30 个点进行进一步分析。Bonferroni 校正后的后续统计分析表明，30 个蛋白质点中只有两个的丰度在 1% 的概率水平上存在显著差异。事件 2 中的两个蛋白质点（异黄酮还原酶和奎宁氧化还原酶样蛋白）与对照和其他两个转基因事件有显著差异。所有 30 个蛋白质点都通过质谱 (MS) 进行分析和鉴定，然后使用 Mascot 搜索 NCBI 数据库 搜索引擎。除蛋白质外，还通过 LC-MS 分析了两类酚类化合物，即异黄酮和酚酸。结果表明，在对照或三个转基因事件中，这两类酚类化合物的含量或分布没有系统性差异。