微生物与生化技术杂志

抽象的

结直肠癌外周血基因表达谱

Chi-Suan Huang, Harn-Jing Terng, Yu-Chin Chou, Sui-Lung Su, Yu-Tien Chang, Chin-Yu Chen, Woan-Jen Lee, Chung-Tay Yao, Hsiu-Ling Chou, Chia-Yi Lee, Chien-An Sun、Ching-Huang Lai、Lu Pai、Chi-Wen Chang、Kang-Hwa Chen、Thomas Wetter、Yun-Wen Shih 和 Chi-Ming Chu

背景：评估了在血液检测中检测结直肠癌 (CRC) 的最佳分子标记。微阵列技术在结直肠癌研究中显示出巨大的潜力。微阵列研究中与癌症有显著关联的基因被选为候选基因。汇集互联网公共微阵列数据集可以克服以前研究中样本数量少的限制。目的：使用公共微阵列数据集验证结直肠癌的基因表达谱。方法：进行逻辑回归分析，并确定 CRC 和对照之间每个基因的优势比。 GSE 4107、4183、8671、9348、10961、13067、13294、13471、14333、15960、17538 和 18105 的公共微阵列数据集包括 519 例腺癌和 88 例正常粘膜对照，用于从逻辑模型中验证候选基因并估计其外部通用性。结果：成对选择了 CPEB4、EIF2S3、MGC20553、MAS4A1、ANXA3、TNFAIP6 和 IL2RB 的 7 基因模型，在逻辑回归分析中显示最佳结果（HL p=1.000、R2=0.951、AUC=0.999、准确度=0.968、特异性=0.966 和灵敏度=0.994）。结论：一种新的基因表达谱与 CRC 相关，可能适用于基于血液的检测分析。