微生物与生化技术杂志

抽象的

一种用于快速鉴定微生物的新型网络服务器

奥利维尔·克罗齐、弗朗索瓦·切维内和理查德·克里斯滕

小亚基核糖体 RNA (SSU rRNA) 基因序列现在被广泛用于鉴定微生物。然而，公共数据库现在主要包含 rRNA 基因序列，这些序列是通过 PCR 和克隆从环境样本中分离的 DNA 得到的。这些序列中的大多数注释不充分，没有正确的分类分配。因此，这种序列泛滥使得常规鉴定通常非常繁琐。
我们提出了一种新的网络服务器，用于快速可靠地鉴定微生物分离物。它允许检索相关序列及其分类法，以便进行系统发育分析。该网络工具基于细菌、古细菌和原生动物培养物种的特定数据库。此外，还可以下载有助于鉴定过程的各种数据。该服务器还包括在线软件，可自动显示带注释的系统发育树。