细菌学与寄生虫学杂志

抽象的

基于功能相互作用网络分析的结核分枝杆菌、麻风分枝杆菌和耻垢分枝杆菌的系统水平比较

理查德·O·阿基诺拉、加斯顿·K·马赞杜和尼古拉·J·穆德

麻风分枝杆菌是一种导致麻风病的致病菌，麻风病主要影响皮肤、周围神经、眼睛和上呼吸道粘膜。尽管过去几年通过多药疗法 (MDT) 策略在遏制麻风病方面取得了重大进展，但每年都有新的麻风病病例报告。据世界卫生组织统计，2011 年初麻风病新发病例为 192,242 例。麻风分枝杆菌无法在实验室中培养，但可以在老鼠脚垫中生长，最近由于麻风病易感性，可以在九种带状犰狳中生长。其高度简化的基因组使其成为分枝杆菌属内还原进化的有趣模型；它与结核分枝杆菌 (MTB) 拥有相同的祖先。之前已生成 MTB 的功能网络，并进行了广泛的计算分析，以根据网络的拓扑特性揭示生物体的生物组织。在这里，我们使用来自公共数据库的基因组序列和功能数据为另一种生长缓慢的细菌麻风分枝杆菌 (MLP) 和生长迅速的非致病性结核分枝杆菌 (MSM) 构建蛋白质功能网络。结合 MTB 网络，这为比较三种具有不同基因组大小的分枝杆菌提供了机会。在本文中，我们使用网络中心性度量系统地比较 MTB、MLP 和 MSM，以在系统生物学层面量化这些生物体之间的差异，并研究网络生物学和进化。