植物病理学与微生物学杂志

抽象的

AFLP 指纹识别立枯丝核菌和 Waitea circinata 种下组

Bimal S. Amaradasa、Dilip Lakshman 和 Keenan Amundsen

由 Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk 和 Waitea circinata Warcup 和 Talbot 变种（无性型：立枯丝核菌种）引起的斑块疾病对几种重要草坪草种的成功维护构成了严重威胁。依赖田间症状来识别立枯丝核菌病原体可能很困难且容易产生误导。不同的立枯丝核菌种和吻合组 (AG) 对常用杀菌剂的敏感性不同，并且它们具有不同的致病温度范围。因此，正确识别病原体对于预测疾病进展和制定未来的疾病管理决策非常重要。通过吻合反应对立枯丝核菌种进行分组非常困难且耗时。通过对内部转录间隔区 (ITS) 进行测序来识别立枯丝核菌分离株的成本可能过高。由于ITS 区域的多态性，某些立枯丝核菌分离株难以测序。扩增片段长度多态性 (AFLP) 是一种可靠且经济有效的指纹识别方法，可用于研究许多生物的遗传多样性。尚未进行详细分析以确定 AFLP 是否适用于推断立枯丝核菌分离物的种内水平。本研究的目的是开发 AFLP 指纹识别技术，以识别未知的立枯丝核菌分离物的种内水平。使用由四对引物生成的 AFLP 标记分析了 79 个先前表征的立枯丝核菌 (n=55) 和 W. circinata (n=24) 分离物。算术平均值非加权配对组法 (UPGMA) 正确地根据 AG、AG 亚组或 W.circinata 变种对立枯丝核菌和 W.circinata 分离物进行分组。主成分分析 (PCA) 证实了 UPGMA 聚类。据我们所知，这是首次使用 AFLP 分析方法来鉴别多种立枯病菌分离物中的 AG、AG 亚组或 W.circinata 品种。