植物病理学与微生物学杂志

抽象的

黑胡椒根腐病病原菌辣椒疫霉菌全长诱导素基因的扩增、克隆及计算机预测

Vijesh Kumar IP、Reena N、Anandaraj M、Eapen SJ、Johnson GK 和 Vinitha KB

诱导素是一类由疫霉菌分泌的小蛋白，可诱导受感染植物的叶片坏死。本文，我们报道了从辣椒疫霉菌中克隆诱导素基因，辣椒疫霉菌是一种卵菌纲植物病原体，可对多种宿主植物造成严重损害。使用基于其他疫霉菌已知诱导素基因保守基序设计的引物扩增诱导素序列。PCR 扩增产物大小为 256 bp，测序产物的 BLAST 分析显示与辣椒疫霉菌的 alpha-诱导素序列完全匹配。随后，尝试通过查询基因组中的扩增产物，从辣椒疫霉菌的基因组序列信息中鉴定诱导素的完整基因。对全基因组进行局部 BLAST 搜索确定了整个编码序列。进一步的序列分析确定了启动子序列、转录起始位点、前导信号序列和核心诱导素结构域，其中保守有 6 个半胱氨酸残基。此外，还建立了辣椒素的三维结构模型，并利用分子对接研究了甾醇和辣椒素的结合亲和力。所开发的模型预测了其对Tyr 47的强结合亲和力。