细菌学与寄生虫学杂志

抽象的

抗原结构相似性作为抗体交叉反应的预测指标

Christopher A. Beaudoin*、Tom L. Blundell

抗体是适应性免疫系统的重要组成部分，其功能是中和外来入侵者，例如细菌和寄生虫病原体。然而，由于 B 细胞表位与其他蛋白质区域通常难以区分，因此仍然难以预测。过去的表位预测工具很大程度上依赖于氨基酸序列相似性；然而，将三维蛋白质结构分析纳入表位预测算法已被证明可以提高检测准确性。此外，文献中尚未广泛探讨抗原蛋白之间结合交叉反应抗体的结构比较。最近的研究表明，在预测抗体交叉反应性方面，查看共享表位结构很有用，这可能有助于了解感染性病原体与感染后诱发的自身免疫性疾病之间的交叉免疫。因此，本文讨论了在检测共享表位时包括结构相似性比较的潜在影响。随着三维计算蛋白质建模方法确定大量结构信息，执行这些分析的能力变得更加可行。