基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

尝试验证恶性间皮瘤中表面增强激光解吸电离飞行时间衍生的驱动蛋白生物标志物

Stephen M. Brindley、Brian C. Tooker、Harvey I. Pass 和 Lee S. Newman

表面增强激光解吸/电离飞行时间 (SELDI-TOF) 质谱法可让研究人员在蛋白质组中寻找疾病的生物标志物。使用传统方法验证 SELDI-TOF 结果会产生不同的结果。研究人员利用实时 PCR、ELISA 和蛋白质印迹试验试图确认石棉相关癌症与驱动蛋白家族蛋白 KIF5A 和 KIF18A 之间的联系。这些蛋白质是使用 SELDI-TOF 和分类回归树分析 (CART) 在石棉相关癌症患者血清中鉴定出来的。当使用特征明确的石棉纤维来刺激间皮细胞系时，观察到 KIF5A 和 KIF18A RNA 表达的混合结果。用蛋白质印迹分析比较间皮瘤细胞系与转化间皮细胞的蛋白质水平，得出了不确定的结果，对从同一患者身上获取的人类间皮瘤和非癌性腹膜的蛋白质印迹分析也得出了不确定的结果。这些结果表明，SELDI-TOF CART 检测到的驱动蛋白家族蛋白不太可能用作恶性间皮瘤的生物标记。