药物基因组学和药物蛋白质组学杂志

抽象的

超越 SNP 和 CNV：多态性串联重复序列的药物基因组学

叶夫根尼·克雷涅茨基

多态性短串联重复序列 (STR) 是一类独立的基因突变，它与单核苷酸多态性 (SNP) 和拷贝数变异 (CNV) 一起可以解释药物治疗反应的变化。STR 在药物基因组学研究中引起了人们的兴趣，因为它们在人类基因组中普遍存在，并且它们被认为是基因表达调节剂的功能性作用。根据搜索算法，人类参考基因组中有大约 700,000-1,000,000 个 STR 基因座，其基序长度为 2-6 bp。STR 在非翻译区 (UTR)、蛋白质编码序列和内含子中非随机分布，并且在人类基因的启动子区域中过度表达。STR 的功能性作用已通过对基因表达、剪接、蛋白质序列的影响以及与致病作用的关联得到证实。STR 的一个固有属性是通过重复单元数量的扩展或收缩而导致的高突变率。 STR 长度的变化在调节基因表达方面起着重要作用，STR 很可能是减弱多种基因表达的通用调控元件。阐明 STR 对基因表达的影响可能在一定程度上解释药物反应的变化，而这无法通过仅关注 SNP 或 CNV 的分析来实现。本综述总结了多态性 STR 在临床表现（包括对药物治疗的反应）中的作用。