水产养殖研究与发展杂志

抽象的

太平洋白虾养殖池中原核和真核微生物群落的特征

侯东伟、曾深正、刘健、严慕婷、翁少平、何建国、何建国、黄志坚

本研究分析了来自5个不同太平洋南美白虾养殖池塘的30个水体样品中原核和真核微生物的群落组成和优势分类。利用高通量测序技术对16S rRNA基因和18S rRNA基因的V4区进行测序。共选取1,387,317个16S rRNA和1,612,056个18S rRNA基因片段进行分类，其中包括3,841个原核生物OTU和990个真核生物OTU。结果发现，所有的16S rRNA序列至少隶属于47个细菌门类，而18S rRNA序列则隶属于50个真核生物门类。在所有30个样品中，门级别上的优势原核生物和真核生物群落的组成相似性较高，但丰度相似性不高。原核生物群落中的优势成分有放线菌、变形菌、蓝藻、浮霉菌、疣微菌、拟杆菌、绿藻、绿屈挠菌、厚壁菌和螺旋体；真核生物群落中的优势成分有尾藻门、绿藻门、节肢动物门、未鉴定的原生藻菌、未鉴定的真菌、定根藻纲、纤毛虫门、软体动物门、Choanomonada和Jakobida。同样，30个样品之间在属水平上存在显著差异。丰富度和多样性结果表明，5个池塘中原核微生物和真核微生物均具有复杂的群落组成，而不同时期、不同池塘的Chao指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数值差异不显著（P>0.05）。