植物病理学与微生物学杂志

抽象的

从突尼斯各个番茄种植地点回收的番茄相关根际细菌的表征

纳达·欧海比-本·阿卜杜勒贾利勒、杰西卡·瓦兰斯、乔纳森·格博尔、埃米莉·布鲁兹、吉列尔梅·马丁斯、帕特里斯·雷伊和梅吉达·达米-雷马迪

在本研究中，从健康番茄植株的根际共获得了 200 个根际细菌分离株，这些番茄植株生长在有严重土壤传播疾病历史的田地中，主要是冠腐病和根腐病。筛选了它们抑制核盘菌和立枯丝核菌体外生长的能力，在 200 个测试的分离株中，有 69 个和 57 个分离株显示出能够显著抑制目标病原体的菌丝生长，与对照相比，抑制率分别达到 11-62%。选择了 25 个最有效的分离株，这些分离株对两种真菌的抑制率比对照高出 45% 以上，并对其进行了形态学、生化、分子和代谢表征。这组番茄相关根际细菌表现出极大的形态学和生化多样性。 16S rRNA 和 rpoB 基因测序可鉴定出四种属，即芽孢杆菌、金杆菌、肠杆菌和克雷伯氏菌。最常见的种类是解淀粉芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、阴沟肠杆菌、济州梭菌和肺炎克雷伯氏菌。筛选其促进植物生长的特性后，发现 20 种分离物能够产生铁载体，18 种具有可溶性磷酸盐，19 种能够合成吲哚-3-乙酸 (IAA)。脂肽生物合成基因的 PCR 扩增表明，18 种和 16 种分离物中分别存在编码 fengycin A 和 bacillomycin D 生物合成的基因。使用 Biolog™ Ecoplates 进行的代谢表征表明，番茄相关根际细菌表现出较高的代谢活性，并且随着培养时间的增加，它们能够使用多种碳源。根据它们的代谢特征，这些根际细菌分离株被分为在不同采样时间（培养 24、48 和 120 小时）产生的八个主要簇。发现平均孔色发育 (AWCD) 值与香农多样性指数呈正相关。