穆罕默德·阿明·阿尔马西和赛义德·穆罕默德·侯赛尼·德哈巴迪
环介导等温扩增(LAMP)检测是一种在恒温下扩增DNA的新技术,具有高特异性、灵敏度、快速性和效率。为了将逆转录PCR(RT-PCR)、逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)和DAS-ELISA等诊断检测所需的时间减至最短,采用并优化了基于马铃薯Y病毒(PVY)基因组的创新比色IC-RT-LAMP和IC-RT-PCR方案。首先,进行DAS-ELISA检测,在包含95个可疑样本的集合中检测病毒。最后,检测出5个样本为阳性样本。然后,通过分子方法验证阳性样本。在这方面,所有四个RT-LAMP引物(即F3、B3、FIP和BIP)以及RT-PCR引物(F和B)都是根据PVY基因组的外壳蛋白基因(CP)选择的。尽管 DAS-ELISA、RT-PCR 和 RT-LAMP 检测法都可以成功检测出阳性感染植物样本,但考虑到时间、安全性、灵敏度、成本和简便性,RT-LAMP 检测法总体上更胜一筹。此外,结果表明,与 RT-PCR 相比,RT-LAMP 检测法灵敏度高 100 倍,速度快 3 倍。LAMP 检测法是在水浴中完成的,无需任何热循环仪或先进的实验室设备。同时,在六种用于准确检测 IC-RT-LAMP 产品的不同视觉染料中,羟基萘酚蓝、GeneFinder TM和 SYBR Green I 可以在封闭的试管方法中产生长时间稳定的颜色变化和亮度,以防止交叉污染风险,最终被认定为最佳染料。因此,我们提出将这种比色检测法作为一种高度可靠的替代病毒识别系统,用于 PVY 识别和其他可能基于病毒的疾病。