水产养殖研究与发展杂志

抽象的

利用种特异性分子标记对南美鲮和海鲮自然种群遗传多样性的比较分析

Faisal Tasleem*、Shahid M、Hina Fatima、Numan Gulzar M

印度鲮（Labeo rohita，俗称南亚鲮）和印度鲮（Cirrhinus marigala，俗称莫拉卡）是整个印度次大陆经济上最重要、养殖最广泛的鱼类。对这些物种进行遗传评估对于适当的监督、保护和有利可图的生产至关重要。有各种类型的分子标记可用，但 SSR 是最重要的一种，因为它们分布均匀、基因组丰富、共显性、多态性、低成本检测和多等位基因性质。在本研究中，从巴基斯坦杰纳布河的 Head Punjnad、Head Muhammad Wala 和 Head Trimmu 地区采集了每个物种的十个样本。提取DNA后，扩增5个简单序列重复标记，在PAGE上进行解析，对基因型数据进行等位基因评分，借助POPGENE版本1.32、FSTAT版本2.9.3.2、Jaccard和Dice相似系数、简单匹配分析和NTSYS-PC软件包的SIMQUAL程序，分析不同的遗传多样性指数。

就Labeo rohita而言，共检测到 26 个等位基因，260 个位点，其中 189 个被发现具有多态性。5 个标记的多态性范围为 43.33%-96%，平均值为 72.69%。等位基因频率范围为 0.2000-0.9000，平均值为 0.4600；等位基因数范围为 4.000-9.000，平均值为 5.2000；基因多样性范围为 0.1800-8800，平均值为 0.6360；PIC 值范围为 0.1638-0.8680，平均值为 0.6012。10 个采集样本之间的成对遗传差异范围为 0.400-0.900，成对遗传相似性范围为 0.100-1.000。基于UPGMA的聚类分析将10个南美鲮样品分成3个聚类和3个亚聚类；同样，海鲮的5个SSR标记在10个样品中共检测到30个等位基因，300个位点，其中多态性位点240个，多态性位点范围为70%～96%，平均值为80%；等位基因频率范围为0.4000～0.9000，平均值为0.6600；等位基因数范围为4.000～9.000，平均值为6.000；基因多样性范围为0.1800～0.7800，平均值为0.4680；PIC值范围为0.1638～0.7578，平均值为0.4422。十个海鲮鱼样本之间的成对遗传差异范围为 0.2000-0.800，成对相似性范围为 0.200-1.000。基于 UPGMA 的聚类分析将所有海鲮鱼样本分为三个聚类和三个子聚类。这项研究表明，巴基斯坦政府和相关机构应采取认真措施改善这些物种尤其是海鲮鱼的遗传结构。