抽象的

基于系统发育标记16S RNAr、recA、rpoB和ITS1的铜绿假单胞菌分子检测性能比较评估

Comoé Koffi Donatien Benie、Adjéhi Dadié、David Coulibaly N'Golo、Nathalie Guessennd、Solange AKA、Koffi Marcellin DJE 和 Mireille Dosso

铜绿假单胞菌可能与食物中毒有关。它对免疫功能低下或虚弱的人具有高度致病性,导致发病率和死亡率很高。本研究的目的是确定适合铜绿假单胞菌分子鉴定的系统发育标记。用分光光度法测定核酸的纯度和浓度。用聚合酶链反应 (PCR) 评估了使用系统发育标记 (16S RNAr、recA、rpoB、STS1) 的灵敏度反应和 42 个菌株的阈值检测。DNA 提取物在 230 nm 处的平均吸光度为 2.1,平均比率 (A260/A280) 为 1.7。铜绿假单胞菌参考菌株ATCC 27853的检测阈值为rpoB 0.8 μg/ml,16S标记物RNAr和recA各7.6 μg/ml。阳性对照菌株CP2:1125A和CP3:API的检测阈值分别为rpoB基因1.2 μg/ml和0.1 μg/ml,recA基因的检测阈值分别为12.3 μg/ml和0.9 μg/ml。rpoB管家基因的灵敏度为97.4%,其次是recA和16S RNAr,分别为87.2%和82.1%。rpoB基因的系统发育分辨率高于16S rRNA和recA基因。与ITS1标记物未观察到敏感反应。核酸的质量和纯度以及系统发育标记的选择是 PCR 分析最关键的因素。

免责声明: 此摘要通过人工智能工具翻译,尚未经过审核或验证