生物分子研究与治疗杂志

抽象的

利用二维核磁共振光谱和理论方法对[ 11 Ψ 12 (CN 4 )]ScyII 和[ 15 Ψ 16 (CN 4 )]ScyII–两种 Scyliorhinin II 类似物的构象进行研究

Krzysztof Brzozowski、Emilia Sikorska、Hanna Miecznikowska、Katarzyna Konecko、RafaÅ‚ Åšlusarz、Jolanta Kumirska、Witold Mozga、Jacek Olczak、Janusz Zabrocki、Sylwia Rodziewicz-MotowidÅ‚o 和 Zbigniew KaczyÅ„ski

在 DMSO-d6 中对 scyliorhinin II 的两种类似物 [11Ψ12(CN4])]ScyII 和 [15Ψ16(CN4)]ScyII 进行了构象分析。应用了 2D NMR 技术和约束分子动力学。我们之前的研究表明，Scyliorhinin II 在 DMSO-d6 溶液中采用三个顺式肽键。此外，在其两种类似物 [Aib16] ScyII 和 [Sar16]ScyII 中，我们也发现了顺式肽键几何构象。考虑到以上情况，我们决定对约束 ScyII 类似物进行广泛的构象研究。为此，我们将四唑基团引入到所研究的任一肽中。这些肽是使用 Fmoc 化学通过固相法合成的。对于两种类似物，记录了以下光谱：TOCSY、NOESY、ROESY、DQF-COSY 和一组温度光谱。为了获得最终结构，我们使用 XPLOR 3.11 程序中实现的 CHARMM 力场进行了受限分子动力学模拟。我们的计算结果产生了两个集合，每个集合有 10 种构象。通过比较获得的结构，我们发现引入 1,5-取代四唑环会对三维结构产生局部和整体影响。