全球生物学、农业与健康科学杂志

抽象的

缺血性心肌病相关miRNA及基因表达谱的构建：生物信息学分析

Phong Son Dinh、Jun-Hua Peng、ChauMy Thanh Tran、Thanh Loan Tran、Shang-Ling Pan

目的：缺血性心肌病（ICM）是近几十年来老年人发病和死亡的最常见原因，其中一个重要原因是其确切的发病机制尚不明确。

方法：从GEO数据库下载5个数据集，利用R语言RobustRankAggreg包识别差异基因表达（DGE），利用Limma包评估差异miRNA表达，利用clusterProfiler数据库确定基因潜在功能，利用cyTargetLinker预测miRNA-DGE调控网络，利用STRING工具、MCODE和BiNGO工具构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。

结果：鉴定出91个miRNA和274个潜在基因。其中，COL1A1、IGF1和CCND1参与了多条信号通路；miR-9-5p在ICM中发挥关键作用。

结论：我们的研究揭示了ICM的潜在关键基因和miRNA以及可能的潜在分子发病机制，这是为早期干预该疾病开辟新途径的关键一步。

目的：缺血性心肌病（ICM）是近几十年来老年人发病和死亡的最常见原因，其中一个重要原因是其确切的发病机制尚不明确。

方法：从GEO数据库下载5个数据集，利用R语言RobustRankAggreg包识别差异基因表达（DGE），利用Limma包评估差异miRNA表达，利用clusterProfiler数据库确定基因潜在功能，利用cyTargetLinker预测miRNA-DGE调控网络，利用STRING工具、MCODE和BiNGO工具构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。

结果：鉴定出91个miRNA和274个潜在基因。其中，COL1A1、IGF1和CCND1参与了多条信号通路；miR-9-5p在ICM中发挥关键作用。

结论：我们的研究揭示了ICM的潜在关键基因和miRNA以及可能的潜在分子发病机制，这是为早期干预该疾病开辟新途径的关键一步。