基因科技

抽象的

检测哺乳动物细胞 DNA 中的 5-羧基胞嘧啶

高益华、李健、陈斌、杨清进、张俊杰、张立健、黄琼琳、叶晓霞、蔡春

5-羧基胞嘧啶（5caC）是DNA去甲基化途径中胞嘧啶修饰的重要衍生物，但其准确定量一直是个难题，尤其是在哺乳动物组织中，其原因可能在于哺乳动物体内5caC的含量极微量，而现有技术的灵敏度不够高。本文报道了一种新的LC-MS/MS方法，可准确定量哺乳动物细胞中的5caC。合成5caC标准试剂，用甲酸水解基因组DNA，采用HILIC LC-MS/MS检测目标化合物5caC。结果表明，5caC普遍存在于小鼠脏器及癌组织中，小鼠脑组织中5caC的含量高于肺和肝，而结直肠癌组织中5caC的含量较癌旁组织明显降低。该结果提示5caC可能与肿瘤发生发展有关，并在神经功能的表观遗传调控中起主导作用。