勇冲和池松英幸
疫苗接种对流感病毒动态的影响在很大程度上仍是未知的。2014-2015 年流感季节，日本和美国使用了不同的 A/H3N2 疫苗株。为了研究不同疫苗株如何影响存活变体的选择，我们比较了日本和美国的血凝素 (HA) 序列。我们分离了来自 38 名接种疫苗和 47 名未接种疫苗的日本患者的共 85 个 A/H3N2 样本（33 个来自 2013-2014 年日本流感季节，52 个来自 2014-2015 年日本流感季节），并使用下一代测序仪进行了基因分析，以便与 GenBank 数据库中引用的 113 个美国分离株（30 个来自 2013-2014 年日本流感季节，83 个来自 2014-2015 年日本流感季节）进行比较。 2014-2015年日本和美国疫苗株的HA1氨基酸（AA）差异位于128（表位B）、142（A）、145（A）和198（B）位点。与2014-2015年疫苗株相匹配的日本分离株中的145S和198S在两个季节之间显著下降，而美国分离株则完全维持（145S为57.6% vs. 5.8%，P<0.0001；198S为100.0% vs. 75.0%，P=0.0012）。 128A 和 142G 的优势在日本分离株中也消失了，将这些 AA 与 2014-2015 年疫苗株的 AA 进行匹配时观察到了这一点（128A 为 72.7% vs. 19.2%，P<0.0001；142G 为 75.8% vs. 15.4%，P<0.0001）。我们的数据表明，疫苗选择可能与遗传上远离疫苗株的流感变异株的出现有关。