基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

牛乳腺炎微生物组成和基因组功能潜力的动态变化

M. Nazmul Hoque、Munawar Sultana、M. Anwar Hossain*

我们对之前发表的题为“牛乳腺炎进展的微生物组动态和基因组决定因素”的研究进行了简要回顾，其中我们报告了在牛乳腺炎的不同病理生理状态下，微生物组组成可能因基因组功能潜力而发生的动态变化。利用尖端的全宏基因组测序 (WMS) 方法，我们报告了临床乳腺炎 (CM)、复发性临床乳腺炎 (RCM)、亚临床乳腺炎 (SCM) 和健康 (H) 牛奶宏基因组 (CM>H>RCM>SCM) 中微生物组组成和丰度的明显变化。细菌是主要的微生物域 (>99.0% 相对丰度)，其次是古菌和病毒。四个宏基因组中细菌组组成的动态变化在数量上主要由乳腺炎宏基因组中 67.19% 的以前未报告的机会性菌株所致。这项研究还报告了这些宏基因组中微生物组的独特和共同分布。除了微生物组组成和多样性之外，该研究还报告了 CM、RCM、SCM 和 H 微生物组中几种毒力因子相关基因 (VFG) 和抗生素抗性基因 (AGR) 的关联。功能注释检测到了与不同乳腺炎发作相关的几种代谢途径。因此，已发表的数据表明，不同类型的乳腺炎中微生物组组成的变化、VFGS、ARG 和基因组功能潜力的同时评估有助于开发基于微生物组的乳腺炎诊断和治疗方法，并对减少这种疾病造成的经济影响具有重要意义