基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

表观遗传学进化和组蛋白替换：果蝇 H2AvD 的进化变化

松尾义德

利用 12 种果蝇的序列分析了果蝇 H2A 和 H2AvD 基因（编码组蛋白）的进化变化，以了解组蛋白置换和表观遗传学的进化。编码组蛋白苏氨酸激酶的 Ball 基因在 7 种果蝇中与 H2AvD 基因头对头排列。在 H2AvD 基因上游区域还发现了一个高度保守的 DNA 序列；这个序列很可能是一个转录信号，因为该序列在其他四种没有上游 Ball 基因的果蝇中也是保守的。在所研究的 11 种果蝇中，编码钙结合结构域的 SPARC 基因在 H2AvD 基因下游区域尾对尾排列。在第一个内含子剪接位点的 H2AvD 基因区域发现了一个中度保守的 DNA 序列。在 17 种氨基酸中，有 11 种 H2A 和 H2AvD 基因的密码子使用情况不同，并且发现氨基酸的密码子使用情况具有置换组蛋白（H2AvD、H4r、H3.3A 和 H3.3B）的特征。H2A 基因中几个组蛋白修饰位点的密码子使用情况存在很大差异。这些结果表明，与 H3.3 和 H4r 基因不同，在 H2AvD 基因中，不仅转录后控制，而且转录控制也发挥了作用。除了转录后控制（如剪接和翻译）之外，转录控制系统的发展必定发生在组蛋白置换和表观遗传系统的进化过程中。