致癌与突变杂志

抽象的

15q21 区域精细定位表明 TP53BP1 和 B2M 与滤泡性淋巴瘤和弥漫性大 B 细胞淋巴瘤的发生有关

Aya-Bonilla Carlos、Camilleri Emily、Benton Miles、Haupt Larisa M、Marlton Paula、Lea Rod A、Gandhi Maher K 和 Griffiths Lyn R

背景和目的：最近的研究重点是发现滤泡性淋巴瘤 (FL) 和弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 病例中的常见变异，报告了 15q21 区域的杂合性缺失 (LOH) 和缺失事件，表明该区域与 FL 和 DLBCL 的淋巴瘤发生有关。在此，我们通过研究已识别的 LOH 和拷贝丢失事件调查了该区域的遗传结构，并检查了该区域在 FL 和 DLBCL 淋巴瘤发生中的作用。方法：使用来自 FL (n=21) 和 DLBCL (n=21) 病例的拷贝数变异 (CNV) 和高分辨率 LOH 分析的数据，对 15q15.1 和 15q21.1 基因座之间的基因组区域进行精细定位。使用微卫星对该区域的 LOH 进行验证，然后进行定量 PCR (qPCR) 以测量 TP53BP1 和 B2M 的转录丰度。此外，还对来自 24 个 FL 和 23 个 DLBCL 样本的肿瘤 DNA 进行了 B2M 外显子 1 和 2 的直接测序。结果：LOH 和 CNV 数据的整合确定了 15q21 基因座的拷贝丢失变异，该变异跨越 7.5 Mb 区域，涵盖两个 LOH 区域，称为 LOH-1 和 LOH-2。LOH-1 区域跨越 3.4 Mb 并包含 53 个基因，其中 TP53BP1（肿瘤蛋白 p53 结合蛋白 1）和 B2M（β-2 微球蛋白）被确定为最有可能的靶基因，因为它们分别在 DNA 双链断裂 (DSB) 修复和免疫识别中发挥作用。表达分析显示，在伴有 LOH 的 NHL 中 TP53BP1 显著上调，但未观察到 B2M 表达的显著变化。对 FL 和 DLBCL 中 B2M 的外显子 1 和 2 进行直接测序，确定了与 DLBCL 相关的两个单等位基因微缺失。结论：本研究确定了 15q21 基因座的缺失映射覆盖两个 LOH 区域。TP53BP1 和 B2M 基因的 LOH 似乎是 FL 和 DLBCL 肿瘤发生中的常见变异。