基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

宿主基因的基因表达水平和基因集富集分析

近藤洋介、宫崎佐藤

全基因组分析表明，存在位于蛋白质编码基因内含子区域的非蛋白质编码RNA（ncRNA）。内含子ncRNA位于蛋白质编码基因的内含子中，这些内含子被称为宿主基因。我们之前的研究报道了内含子ncRNA基因和宿主基因的基因组特征。然而，宿主基因的转录组特征尚未被研究。在这里，我们报告了宿主基因的基因表达水平分析并研究了宿主基因的生物学功能。我们的结果表明，宿主基因的基因表达水平往往高于非宿主基因。人类和小鼠直系同源的宿主基因比非宿主直系同源基因具有更保守的表达水平。高表达水平的宿主基因涉及神经系统、基因表达、蛋白质修饰和细胞骨架，而低表达水平的宿主基因大多没有富集的生物学功能。这些结果表明宿主基因具有特征性的转录本定量和生物学功能。这些特征可能有助于进一步分析宿主基因表达的调控方式。