致癌与突变杂志

抽象的

结肠直肠癌肿瘤细胞的基因表达荟萃分析揭示与肿瘤发生相关的基因

鲁特维·瓦贾

背景：每年有超过 1200 万人被诊断出患有结直肠癌 (CRC)，超过 60 万人死于该病，结直肠癌是第二大致命癌症。这项工作分析了 CRC 和其他腺体肿瘤样本中的差异基因表达，以确定可能导致 CRC 肿瘤发生的表达变化。

方法：本研究定义了 13 个基因标记，代表 4 个 CRC 肿瘤和 10 个其他起源于结肠的腺状肿瘤。使用基因集富集分析 (GSEA)，使用两个 CRC 标记从 GSEA 识别的前沿基因中定义阳性和阴性 CRC 基因组。然后使用 GSEA 验证两个独立 CRC 基因标记中 CRC 基因组的富集和前沿基因成员资格。然后将分析扩展到四个单独的和 10 个腺状肿瘤标记。通过交叉标记中 GSEA 识别的前沿成员资格来预测与 CRC 肿瘤发生最相关的基因。

结果： CRC 基因识别特征之间存在显著富集，由此定义了阳性（55 个基因）和阴性（77 个基因）CRC 面板。CRC 基因面板和验证特征之间存在非随机显著富集，其中 54 个过度表达和 72 个低表达基因在前沿共享。单独考虑其他腺肿瘤样本并与 CRC 结合，观察到这些特征之间存在显著的非随机富集。CRC 面板中的八个溶质载体家族基因（例如（SLC25A32、SLC22A3、SLC25A20、SLC36A1、SLC26A3、SLC9A2、SLC4A4 和 SLC26A2））在所有基因特征前沿中共享，无论结肠肿瘤类型如何。

结论：本荟萃分析确定了与 CRC 肿瘤发生过程相关的基因表达变化。这些变化可能有助于开发适用于 CRC 患者的治疗方法。