基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

屎肠球菌CRL1879的基因组挖掘和细菌素基因的转录分析

Suárez N、Bonacina J、Hebert EM 和 Saavedra L*

在从九种手工奶酪中分离出的 151 种细菌中，屎肠球菌 CRL 1879 对食源性致病菌单核细胞增生李斯特菌表现出抗菌活性。该分离物在无细胞上清液中产生蛋白酶 K 敏感化合物。基因组分析表明存在肠球菌 A、肠球菌 B、肠球菌 P、肠球菌 SE-K4 样和肠球菌 X 生物合成基因簇。使用生物信息学工具检测编码假定的双组分细菌素的核苷酸序列，此处命名为肠球菌 CRL1879αβ。通过定量实时 PCR 分析 (qRT-PCR) 对所有细菌素基因进行转录分析，发现每种肠球菌基因的转录水平不同。最后，对 251 个屎肠球菌生物项目中的细菌素基因分布进行了分析，并与屎肠球菌 CRL1879 中鉴定的基因进行了比较。判别分析表明，细菌素基因在肠球菌中广泛分布，与菌株的来源无关。

本文提出的结果是一个独特的发现，因为这是首次证明从手工奶酪中分离出的屎肠球菌菌株具有完整的遗传机制，可以产生六种 II 类细菌素和一种 III 类细菌素。