生物学和医学

抽象的

GLAD-PCR 检测结直肠癌相关 DNA 甲基化标志物

Alexey A Evdokimov、Nina A Netesova、Natalia A Smetannikova、Murat A Abdurashitov、Alexandr G Akishev、Boris S Malyshev、Evgeniya S Davidovich、Vladimir V Fedotov、Vitaliy V Kuznetsov、Yuriy D Ermolaev、Andrey B Karpov、Alexey E Sazonov、Ravil M塔豪夫和谢尔盖·赫捷格佳廖夫

已证实许多癌症疾病的基因调控区存在高甲基化。癌细胞中这种异常的 DNA 甲基化是由 DNA 甲基转移酶 Dnmt3a 和 Dnmt3b 催化的，它们主要识别和甲基化 RCGY 序列并形成 R(5mC)GY 位点。最近，基于一种新的甲基定向 DNA 内切酶 GlaI，我们开发了一种 GLAD-PCR 检测方法，可以确定基因组 DNA 特定位置上的 R(5mC)GY 位点。在这项研究中，我们应用 GLAD-PCR 检测方法鉴定与结直肠癌 (CRC) 相关的一些下调基因的调控区中甲基化的 RCGY 位点。该列表包括 ADHFE1、ALX4、CNRIP1、EID3、ELMO1、ESR1、FBN1、HLTF、LAMA1、NEUROG1、NGFR、RARB、RXRG、RYR2、SDC2、SEPT9、SFRP2、SOCS3、SOX17、THBD、TMEFF2、UCHL1 和 VIM 基因。对其中一些基因调控区内选定的 RCGY 位点进行 GLAD-PCR 分析，结果显示肿瘤 DNA 中 CRC 检测具有良好的预后潜力，且灵敏度和特异性相对较高。