生物化学与分析生物化学

抽象的

人类 α-乳清蛋白如何识别 DNA 和 RNA

Nevinsky GA、Alinovskaya LI、Ivanisenko NV、Soboleva SE 和 Sedykh SE

人类 α-乳清蛋白 (LA) 在乳腺细胞中具有重要作用，可激活参与细胞凋亡的胱天蛋白酶。LA 复合物与肿瘤细胞中的 DNA 发生组蛋白相互作用并破坏染色质结构。目前尚无关于 LA 如何识别 DNA 并与染色质的组蛋白和 DNA 相互作用的任何数据。采用逐步增加配体复杂性的方法估计每个 DNA 核苷酸单元对其对人类 LA 的总亲和力的相对贡献。结果表明，LA DNA 结合位点最小配体是正磷酸盐和所有 dNMP 和 rNMP（Kd=(5.0-43)×10-5）。在所有 (pN)n 中观察到三个核苷酸单元对总亲和力的最大贡献，其顺序为 1>2>3，n=4-6 时显著降低，n ≥ 6-7 时 -logKd 对 n 的所有依赖性均达到稳定水平。双链(pN)n 配体与 LA 的总亲和力明显低于单链配体。估算了表征(pN)1-6 每个核苷酸链节(ΔGo)对其总亲和力的具体贡献的热力学参数。计算了 LA-DNA 复合物的空间模型。LA 蛋白序列与参与染色质细胞核相互作用及其与 DNA 复合物相互作用的五种组蛋白 (H1-H4) 的序列具有同源性。推测同源性可能是 LA 与染色质 DNA 相互作用的主要原因，从而导致其结构破坏，以及组蛋白之间以及组蛋白与 DNA 的正确结合。