微生物与生化技术杂志

抽象的

通过虚拟筛选方法鉴定新型丙型肝炎病毒 NS3-4A 蛋白酶抑制剂

Anish Kumar、Rashmi Gupta、Kanika Verma、Kshitija Iyer、Shanthi V 和 K Ramanathan

丙型肝炎病毒（HCV）是全球范围内导致肝硬化和肝癌的主要原因。HCV的复制和病毒多聚蛋白的成熟关键取决于多聚蛋白前体裂解成10个病毒蛋白的过程。NS3-4A丝氨酸蛋白酶在五个连接点中的四个处裂解多聚蛋白的非结构区，因此是开发抗病毒抑制剂的有希望的靶点。目前有许多HCV NS3/4A蛋白酶抑制剂处于临床试验阶段，并且有改善，表明病毒感染率显著降低。然而，大多数PI在治疗过程中会产生与耐药相关的变异，并且仅限于一种或两种HCV基因型。第二代PI MK-5172是唯一的例外，它能有效抑制与第一代PI耐药相关的大多数变异，并且是全基因型的。在本研究中，我们使用最有效的蛋白酶抑制剂 MK-5172，基于相似性搜索研究了有效的先导化合物。我们使用 NCBI 中的 PubChem 数据库进行了虚拟筛选技术，以识别类似先导的分子。该数据库在 95% 相似性搜索中产生了 32 个结果，并对筛选的化合物进行了药代动力学分析 (ADME)。这种基于结构的药物设计确定了三种可以更好地对抗 NS3/4A 蛋白酶的先导化合物。