生物化学与分析生物化学

抽象的

确定动脉粥样硬化病原体的可能药物靶点和候选疫苗

Kanipakam Hema、Vani Priyadarshini I、Dibyabhaba Pradhan、Manne Munikumar、Swargam Sandeep、Swargam Sandeep、Natarajan Pradeep、Suchitra MM 和 Amineni Umamaheswari

动脉粥样硬化是一种慢性炎症性动脉疾病，是心血管（心脏）和脑血管（脑）中风的罪魁祸首，全球发病率和死亡率都很高。最近的流行病学研究表明，肺炎衣原体、牙龈卟啉单胞菌和幽门螺杆菌等传染性病原体与该病有关。因此，确定这三种病原体的常见药物靶点和疫苗候选物对于动脉粥样硬化的治疗和管理至关重要。由于肺炎衣原体在动脉粥样硬化中起着重要作用，因此被选为参考生物。通过实施比较基因组学方法、减法基因组学方法、代谢途径分析、非同源肠道菌群分析和域搜索分析，确定了 35 种针对动脉粥样硬化病原体的常见假定药物靶点。进行了亚细胞定位研究，并确定 UvrABC 蛋白为疫苗候选物。代谢途径分析表明，在 35 种药物靶标中，有 14 种酶参与了与病原体生存、增殖和发病机制相关的关键途径，没有其他机制来合成产品。进行了肠道微生物群分析，以确定不影响人类微生物群的药物靶标。使用 Pfam 和 SMART 数据库对已确定的 14 种药物靶标进行域搜索，并使用 STRING 和 Cytoscape v3.2.0 进行蛋白质网络分析。本研究提出的药物靶标和候选疫苗将作为通过计算机模拟方法设计有效抑制剂和亚单位疫苗的基础，用于对抗由传染性病原体引起的动脉粥样硬化。