基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

玉米天然抗性相关巨噬细胞蛋白 ( NRAMP ) 基因家族的计算机功能预测及响应干旱胁迫的表达分析

Golam Rabby 博士、Mostafa Kamal 博士、Sakib Hasan 博士、Mossabbir Hossain 博士、Numan Islam 博士*

天然抗性相关巨噬细胞蛋白（NRAMPs）在植物中作为金属转运体发挥作用，维持金属稳态。玉米NRAMPs的全基因组鉴定和功能预测尚未研究。全基因组分析鉴定了玉米中7个蛋白质（ZmNRAMP1，ZmNRAMP2，ZmNRAMP3，ZmNRAMP4，ZmNRAMP5，ZmNRAMP6，ZmNRAMP7），分子量为29.08（ZmNRAMP2）至63.20（ZmNRAMP5 ）kDa。除ZmNRAMP1和ZmNRAMP3外，所有ZmNRAMPs都是必需蛋白质（等电点大于7）。ZmNRAMPs中内含子的数量从1到13不等，在玉米和拟南芥的系统发育群（A和B）中几乎一致。所有蛋白质均表现出多个基序（范围从 6 到 10），这些基序在玉米和拟南芥的组中是一致的。我们还进行了跨膜结构域、顺式调控元件、染色体作图和基因本体注释，揭示了重要的功能属性。营养和生殖组织中ZmNRAMPs（ZmNRAMP1、ZmNRAMP2和ZmNRAMP4）表达显著增加可能在重金属吸收、运输和体内平衡中发挥重要作用。在干旱胁迫期间，cc（ZmNRAMP1、ZmNRAMP2、ZmNRAMP4和ZmNRAMP7）的显著上调可能在玉米的抗旱或适应中发挥作用。