基因组学和蛋白质组学数据挖掘杂志

抽象的

微生物蛋白质组学方法对羊带绦虫MHC 结合肽进行灵敏定量预测

Gomase VS Chitlange NR

羊带绦虫是一种绦虫寄生虫，成虫阶段存在于狗的肠道中，而中间体或幼虫阶段存在于羊的肌肉中，可引起羊麻疹。抗原蛋白的肽片段可用于选择非聚体以用于合理的疫苗设计，并增加对免疫系统在传染病中的作用的理解。分析表明，羊带绦虫抗原蛋白的 MHC II 类结合肽是保护宿主免受寄生虫感染的重要决定因素。在本试验中，我们使用 PSSM 和 SVM 算法进行抗原设计，并预测了具有 254 个氨基酸的抗原蛋白的结合亲和力，显示出 246 个非聚体。抗原肽与主要组织相容性复合体 (MHC) I 类和 II 类分子的结合能力预测对于羊麻疹疫苗的开发非常重要。