生物化学与分析生物化学

抽象的

灰林鸻的线粒体基因组分析及系统发育和分化时间评估

大卫·史密斯1、雷纳·罗伊2*

本研究首次报道了Strix aluco的完整线粒体基因组，全长18,632 bp，共有37个基因，包括22个tRNA，2个rRNA，13个蛋白质编码基因（PCG），2个非编码控制区（D-loop）。利用Illumina平台对S. aluco线粒体全基因组进行二代测序，以Tytoninae为外类群，应用PhyloSuite软件构建鸻形目ML-tree和BI-tree ，最后利用Beast 2.6.7软件构建分化时间树，以Miosurniadiurna含化石沉积物的年龄（6.0~9.5 mA）为内校正点。鸻属的共同祖先在更新世（2.58~0.01 mA）期间被证实发生了分化，中更新世秦岭的急剧抬升和更新世的气候振荡共同导致中国大陆南北地区鸻属的分化，冰期-间冰期旋转和冰川避难所的隔离是这一时期鸻属和乌拉尔鸻属共同祖先发生分化的主要原因。本研究为鸻属的演化历史研究提供了参考。