Maria Lagiou、Nikoleta Poumpouridou、Nikolaos Goutas、Dimitrios Vlachodimitropoulos、Aggeliki Pappa、Evi Lianidou、Triantafyllos Liloglou 和 Christos Kroupis
简介:本研究旨在验证创新且可靠的方法,用于研究 RASSF1 基因第一个启动子的 DNA 甲基化(乳腺组织中其主要转录本 RASSF1A 的转录起点)、其 mRNA 表达及其在散发性乳腺癌中的评估。材料和方法:分析了 81 例已知组织病理学数据的冷冻乳腺癌组织以及 4 例正常乳腺组织的 DNA 和 RNA。通过焦磷酸测序评估 DNA 甲基化水平,分析第一个 RASSF1 启动子的 CpG 岛中的 9 个 CpG 二核苷酸。对于 mRNA 表达,使用实时 RT-qPCR 方法,并使用合成标准、SYBR Green PCR 试剂盒和一组适用于所有 RASSF1 转录变体(G 除外)的标准化引物(Qiagen)进行验证。对于 RASSF1 表达的相对定量,使用 2-ΔCt 方法,以 β2-微球蛋白为参考基因。结果:59例RASSF1甲基化正常(72.8%),22例RASSF1高甲基化(27.2%),40例RASSF1 mRNA高表达(49.4%),41例(50.6%)RASSF1低表达。甲基化与RASSF1表达无负相关性(p=0.207)。Logistic回归分析显示,ER受体阴性(p=0.008,OR 0.09,CI 0.14-0.52)、甲基化百分比(p=0.006,OR 7.96,CI 1.82-34.86)和RASSF1表达水平(p=0.047,OR 3.94,CI 1.02-15.29)均会增加淋巴结浸润的可能性。生存分析表明,转移与 mRNA RASSF1 过表达之间存在边际统计学显著相关性(对数秩检验,p=0.040)。结论:评估的检测方法似乎为乳腺癌的临床管理提供了潜在有用的信息。未来应评估用于第二个 RASSF1 启动子甲基化的类似可靠检测方法。关于表达研究,一种针对所有不同 RASSF1 转录本的探针的新设计策略将为研究提供额外的能力,并有可能在散发性乳腺癌的临床评估中使用新的 RASSF1 生物标记物。