水产养殖研究与发展杂志

抽象的

大石斑鱼卵黄蛋白的分子特征

Om AD *、Sharif S、Jasmani S、Sung YY、Bolong AA

卵黄蛋白原 (Vtg) 基因序列是鱼类繁殖的指标，可适应环境因素或影响性腺发育。使用生物信息学软件对大石斑鱼的 Vtg 核苷酸序列进行了描述。使用国家生物技术信息中心网站对获得的 Vtg DNA（与 13 个物种进行比较）推导的氨基酸序列进行同源性搜索。使用分子进化遗传分析 MEGA 版本 5.2.2 进行 Clustal W 分析，构建了系统发育树。为了验证获得的 Vtg 基因序列并阐明 Vtg 的结构与功能关系，使用 DELTA BLAST 对大石斑鱼和其他鱼类的三维结构进行了比较。使用最大似然法 (ML) 和邻接法 (NJ) 进行系统发育分析的结果表明，树分析生成了两个分离的树拓扑结构。尽管来自不同的环境和生态条件，但这种相似性（0.015 距离矩阵观察者）在 Vtg 基因序列方面密切相关。总体而言，表明 Epinephelus lanceolatus Vtg 在进化上与 Poecilia latipinna 更相关。Epinephelus lanceolatus 显示四个主要结构域（Vitellogenin-N、DUF1943、DUF1944 和 VMD），在 Dicentrachus labrax 中也发现过，但与 Clarias macrochepalus、Catla catla 和 Danio rerio 不同。这表明淡水物种 Vtg 结构域的特征是由 Vtg 中 VMD 的存在控制的。可以对大石斑鱼进行分子方法研究，以了解分子对鱼生长的反应，并确定有潜力增加 Vtg 产量以提高鱼卵质量的大石斑鱼个体。