植物病理学与微生物学杂志

抽象的

肯尼亚西部部分野生禾本科植物植原体 16S rRNA 基因的分子鉴定与表征

Adam OJ、Midega CAO、Runo S 和 Khan ZR

在肯尼亚西部，植原体亚群 16SrXI引起的紫花地丁草矮化 (Ns) 病已使许多小农田地中零放牧系统中紫花地丁草 (Pennisetum purpuruem) 的产量降至高达 90% 。据推测，肯尼亚的其他几种野生草类也可能被植原体感染，否则将对紫花地丁草、其他重要饲料和粮食作物构成重大威胁。因此，本研究试图利用 16S 核糖体 RNA（核糖核酸）基因检测和鉴定感染肯尼亚西部野生草类的植原体菌株，并在 2011 年 10 月和 2012 年 1 月在肯尼亚西部的邦戈马县和布西亚县进行的随机横断面调查中采集的 646 个野生草样本中鉴定寄生植原体的野生草种。提取 DNA 并使用嵌套聚合酶反应 (nPCR) 检测植原体。在受感染的紫花苜蓿田附近生长的八种草类中，检测到了两种植原体亚群。报告的两种植原体中，只有一种与 Ns 植原体有关。植原体感染比例与收集的草类种类之间存在很强的相关性（p = 0.001）。C. dactylon、D. scalarum、B. brizantha、贫困草和 P. maximum 的感染比例很高，在肯尼亚西部分布广泛，因此被认为是野生植原体宿主。E. indica 和 C. ciliaris 分布稀少，感染率低。每个调查地点的感染比例存在统计学上的显著差异（p = 0.001）。植原体亚群 16SrXI 和 16SrXIV 是肯尼亚西部野生草类中唯一分布的植原体基因型。植原体亚群 16SrXIV主要感染 C. dactylon 和 B. brizantha 草，而植原体亚群 16SrXI 则具有广谱性，可感染大量野生草类。总体而言，肯尼亚西部有多种野生草类寄主植原体。这些寄主草类可能是肯尼亚西部 Ns 病传播率高的原因，因为它们是 Ns 植原体的储存器。