干细胞研究与治疗杂志

抽象的

用于细胞追踪研究的多模态图像配准新软件

Dietz B、Alexander M、Elhami E、Xiang B、Deng J、Wang F、Chi C、Goertzen AL、Mzengeza S、Freed D、Arora RC 和 Tian G

正电子发射断层扫描(PET) 因其高灵敏度而成为体内分子成像的重要工具。结合磁共振成像 (MRI) 无与伦比的软组织对比度，PET-MRI 可实现细胞追踪研究所需的精确量化。本研究的目的是开发一种能够进行基准配准的基于地标的图像配准程序，以应用于干细胞追踪研究。使用我们基于地标的程序（以 Matlab 编写）配准位于标本周围视野中的基准标记获取的 PET 和 MR 图像。基准标记还用于测试我们的 Matlab 程序以及其他自动图像配准软件的准确性，包括：自动图像配准 (AIR)、FMRIB 的线性图像配准工具 (FLIRT) 和医学图像处理、分析和可视化(MIPAV)，所有这些软件都可以在线免费下载。所有程序都能够成功配准图像；但是，我们的 Matlab 程序提供了最佳的配准精度，基准配准误差 (FRE) 为 1.36 毫米。我们开发的 Matlab 程序可在 www.sourceforge.net/p/matlabaffinereg 免费下载。