微生物与生化技术杂志

抽象的

不同幽门螺杆菌菌株的基因序列相似性较高，16S rRNA 基因无法解释不同菌株的系统发生

吴文发

了解一个物种的不同菌株的进化相关性有助于识别菌株特异性差异，这可能有助于疾病的诊断和治疗。通常，这种菌株水平的分型会通过分子检测（例如 DNA 测序和系统发育树分析）得到增强。这项工作利用不同幽门螺杆菌菌株16S rRNA 基因序列的公开数据来帮助绘制描述不同菌株进化轨迹的系统发育树。多重序列比对的结果显示，不同菌株之间的16S rRNA 基因序列具有高度的保守性。这随后转化为系统发育树结构，表明除一个异常菌株外，不同菌株的进化关系非常密切。即使是异常菌株，其与其他同类的进化距离也不大。总体而言，本研究的结果表明，16S rRNA 基因可能无法捕捉同一物种不同菌株之间的菌株水平系统发育，并指出需要努力阐明该物种其他基因中的这种系统发育效应。这些基因可能在人类致病过程中参与毒力，因此可能受到更高的进化压力和自然选择。