生物学和医学

抽象的

泛素结合（E2）酶的系统发育重建

穆罕默德·汗、凯撒·贾米尔

近几年来，从基因顺序数据中重建系统发育引起了生物学家和计算机科学家的极大关注。泛素广泛存在于真核生物中，在细胞中选择性 ATP 依赖性蛋白质降解中起着关键作用。它在几种类型的癌症中也高度表达。因此，为了了解其在真核生物中的多样性，我们进行了这项研究，使用各种计算方法确定其系统发育。从蛋白质数据库 (PDB) 中提取了泛素结合酶的所有序列，并使用 PHYML 中实现的最大似然法构建了无根系统发育树。这棵树有四个主要簇和一个微型簇。我们根据蛋白质序列进化中功能重要性的位点特异性变化计算了基因簇的差异。然后使用 RASMOL 将差异映射到从 PDB 数据库获得的 ube2c 蛋白质的 3-D 结构上：(IL7K)。从这项研究中，我们得出结论，我们能够指出 E2 发生活跃进化的确切位点，而且显然这些位点受到强烈的净化选择。我们预计这些信息将对肿瘤形成产生一些有用的影响，因为有报道称这种蛋白质的突变可能会促进肿瘤进展。