霍达·瓦济里*
埃及种植的小麦植株表现出类似病毒的症状 使用 RT-PCR 技术对小麦黄矮病进行了鉴定。针对小麦黄矮病毒 (WYDV-PAV) 分离株的两个编码区,即位于开放阅读框 (ORF1) 中的聚合酶基因 (P1) 和位于开放阅读框 (ORF3) 中的外壳蛋白基因。
根据 Genbank 中的 BYDV-PAV 分离株设计了两组特异性引物。克隆并测序了 BYDV-PAV 埃及分离株的 ORF1 和 ORF3 DNA 片段。该序列包含编码病毒聚合酶基因的全长 ORF1。它长度为 910 nt,编码一条预测的 303 个氨基酸的多肽链,M(r) 为 34.67。病毒外壳蛋白ORF3基因序列分析显示其全长603 bp,编码200个氨基酸,分子量为21.96 KDa,但通过对埃及分离株Egy-Wz与NCBI GenBank中现有分离株的多重序列比对,构建系统发育同源树发现,该聚合酶基因在氨基酸和核苷酸水平上与05GG2、PAV 014和PAV014、PAV-Aus分离株的序列同源性分别为76.5%~99%和71.6%~93.2%,而外壳蛋白基因在氨基酸和核苷酸水平上与两个分离株06KM14和05GG2的序列同源性分别为85.1%~99.5%和89.7%~99.2%。